禽類曲霉病主要侵襲下呼吸道（別名 孵化器肺炎、霉菌性肺炎、真菌性肺病）。較少定植于眼、腦、皮膚、關節和內臟，也可引發全身性感染。曲霉病可以是急性的，也可以 是慢性的。急性病在雛雞、雛鴨、雛鵝中通常表現為爆發性 ——高發病率和高死亡率。成年禽類通常是慢性感染。
一、病原學和流行病學
煙曲霉是曲霉病最常見的病原，有時也能分離出黃曲霉、黑曲霉、灰綠曲霉和土曲霉。 這些真菌是世界各地常見的土壤腐生物，生長在溫暖(>25°C)潮濕環境下的有機物中，包括孵化器里破損的雞蛋、通風系統、家禽墊料、飼料、水線料槽等。
曲霉病是非傳播性疾病，通過吸入孢子而感染。初始感染通常發生在孵化場。煙曲霉孢子（無性孢子）通過蛋殼裂縫 或卵內注射后的微裂縫）進入種蛋氣室， 使得在氣室中有真菌生長（真菌性氣室）。對著光看，有死胚的蛋呈綠色。孵化場中的污染來自在孵化期間打開受感染的種蛋。孵化場內的感染也可以源于風道或其他設備。在孵化場感染之后，造成雛禽感染。
吸入污染飼料或禽舍墊料中的孢子也可感染曲霉病。濕墊料中的真菌生長產生大量孢子，當在墊料干燥后孢子會被釋放出來。這就是為什么有時在發現雛禽（雞、鴨、鵝）感染很長時間以后在成年禽中也會出現曲霉病病例。
霉曲霉菌屬中有致病性的種，特別是煙曲菌和黃曲菌，能產生毒素，參與曲霉菌對家禽的致病作用。
二、臨床癥狀和病變
曲霉在孵化場被污染的雛禽在感染后3-5天出現呼吸道癥狀：由于氣管阻塞而煩躁不安、呼吸急促、張嘴呼吸，很快發生死亡。有的呼吸困難但沒有啰音或其他呼吸道雜音。在這種急性呼吸道疾病中，1-3周齡雛禽的死亡率為5-50%。存活禽常表現出慢性呼吸癥狀，生長停滯，可能嗜睡并發育不良，死亡率為5%。其他臨床癥狀有：斜頸、中樞神經系統異常、結膜水腫等。在慢性感染的成年禽中，該病可能維持亞臨床狀態并逐漸發展到呼吸困難。有時氣管和鳴管中曲霉病引發的滲出物會導致窒息。
曲霉肉芽腫皮炎與疫苗接種后感染的并發癥有關。
曲霉病有單側眼感染，初期流淚，然后出現結膜炎。在呼吸道（氣管、支氣管、肺、氣囊）中發現有病變。大體病變有差異，從小斑塊直至 1-9毫米大的白色到黃色結節。氣囊中的病變可能顯示菌絲體，產生帶有分生孢子的分生孢子梗。煙曲霉形成孢子的菌落是藍綠色的，肉眼可以看到。也可在腦、眼和內臟中看到肉芽腫。年齡較大禽的肺部病灶會相當大，肺部生長著有黃色的纖維蛋白滲出物。